R
{{category GLMM}}

!!!glmmTMB
Template Model Builder
https://cran.r-project.org/web/packages/glmmTMB/index.html

!!事前に読んでおく基本文献
Bolker et al. (2009)
Bolker (2015)
Zuur et al. (2009)
Millar (2011)
Zuur et al. (2013)

!引用
Brooks ME, Kristensen K, van Benthem KJ, Magnusson A, Berg
CW, Nielsen A, Skaug HJ, Maechler M, Bolker BM (2017). “glmmTMB
Balances Speed and Flexibility Among Packages for Zero-inflated
Generalized Linear Mixed Modeling.” The R Journal, 9(2), 378–
400. doi:10.32614/RJ-2017-066.


!パッケージ
library("glmmTMB")
library("bbmle")
library("ggplot2")


!!使い方 glmmTMB( y ~ x, data=data)
* ランダム効果がある場合もない場合も使える
** ない場合は単に、ランダム要因を入れないだけ

!!References
https://cran.r-project.org/web/packages/glmmTMB/vignettes/glmmTMB.pdf
https://cran.r-project.org/web/packages/glmmTMB/index.html
https://github.com/glmmTMB/glmmTMB
https://sites.google.com/view/naokikatayama/r-codes/glmms