R !!!ノンパラメトリック検定 {{outline}} ---- !!二群の比較 *対応のあるデータの場合は、ウィルコクソン符号付順位和検定 **wilcox.test() > wilcox.test(prepost$pre, prepost$post) Wilcoxon rank sum test with continuity correction data: prepost$pre and prepost$post W = 5090, p-value = 1.167e-14 alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0 「差はない」が帰無仮説で、p値が0.05を下回っているので、これは差はないとは言えない(「差はある」) *対応のないデータの場合は、マン・ホイットニー検定 **これもwilcox.test()で。 **もしくは、青木先生のU.test() http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/u-test.html ![Brunner-Munzel Test|http://sugiura-ken.org/wiki/wiki.cgi/exp?page=R%2Epackage#p12] *これでやって、効果量は、Cliff's deltaを明記するのがよいですね。 R.package参照 !!3群以上の比較 *対応のあるデータの場合は、フリードマン検定(Friedman's Test) *正規分布を想定する平均の差の検定ではなく、<<中央値>>の差の検定 **friedman.test() ***対象はデータフレームではなくマトリックス ***friedman.test(as.matrix(データフレーム)) *対応のないデータの場合は、クラスカル・ウォリス検定 **kruskal.test()