*disclaimer
636493
kruskal.test
対応のない、３群以上の ノンパラメトリック検定
> head(DD_all)
Group MDD
1 1 1.000000
2 1 1.666667
3 1 2.200000
4 1 2.000000
5 1 1.666667
6 1 1.333333
> attach(DD_all)
> kruskal.test(MDD~Group)
Kruskal-Wallis rank sum test
data: MDD by Group
Kruskal-Wallis chi-squared = 14.449, df = 3, p-value = 0.002354
- 中央値が等しいという帰無仮説は棄却（＝＞差がある）
- どこにあるかは、多重比較：ボンフェローニの調整をした上でWilcox.testで二つずつ組み合わせて（pairwise）
> pairwise.wilcox.test(MDD, Group, p.adj="bonferroni", exact=F)
Pairwise comparisons using Wilcoxon rank sum test data: MDD and Group 1 2 3 2 0.8584 - - 3 0.4452 0.0041 - 4 1.0000 1.0000 0.0049 P value adjustment method: bonferroni
- 2と3の間と3と4の間に差がある
1:Low 2:Mid 3:High 4:Native
- MidとHighは差があり、HighとNativeの間にも差があるが、MidとNativeの間には差がない？
https://sugiura-ken.org/wiki/