*disclaimer
1075558
glmmTMB
Template Model Builder
https://cran.r-project.org/web/packages/glmmTMB/index.html
パッケージ
library("glmmTMB")
library("bbmle")
library("ggplot2")
使い方 glmmTMB( y ~ x, data=data)
- ランダム効果がある場合もない場合も使える
- ない場合は単に、ランダム要因を入れないだけ
References
https://cran.r-project.org/web/packages/glmmTMB/vignettes/glmmTMB.pdf
https://cran.r-project.org/web/packages/glmmTMB/index.html
https://github.com/glmmTMB/glmmTMB
https://sites.google.com/view/naokikatayama/r-codes/glmms
事前に読んでおく基本文献
Bolker et al. (2009)
Bolker (2015)
Zuur et al. (2009)
Millar (2011)
Zuur et al. (2013)
引用
Brooks ME, Kristensen K, van Benthem KJ, Magnusson A, Berg
CW, Nielsen A, Skaug HJ, Maechler M, Bolker BM (2017). “glmmTMB
Balances Speed and Flexibility Among Packages for Zero-inflated
Generalized Linear Mixed Modeling.” The R Journal, 9(2), 378–
400. doi:10.32614/RJ-2017-066.
https://sugiura-ken.org/wiki/